1.空调系统划分：洁净空调系统更主要的作用就是消除热湿干扰及尘埃污染，以便保持实验室内的空气品质。目前，洁净空调系统主要分为集中式、分散式、半集中式这3类。
2.洁净室压差控制：由于实验室内的洁净室与其他房间要维持稳定的压差，所以在实验室洁净空调系统设要遵守2条规范标准。
3.新风量计算：想要准确计算量计算必须有3个参数，第1个是补偿室内排风量和保持室内正压所需新风量之和，第2个是室内每人新风量不应小于40m?/h，第3个是新风量取保持正压所需新风量与补偿室内排风量之和。
4.送风量计算：需要按照换气次数来计算，且洁净室的洁净度等级不同，换气次数也不同。具体来说，万级、10万级、100万级洁净室的换气次数分别为25h-1、15h-1、10h-1。此外，计算时可以选几个热湿负荷较大的房间，根据热湿负荷数值来计算房间送风量。
5.空调方案确定：所谓空调方案，主指气流组织选择，且有技术要求、送风与回风指标这2个参数。参数由实验室使用者提供，按生物制品生产洁净要求设计。
6.空调机组设计选型：首先来看机组内部，其内部要光洁，且易于清洁，内部表面与内部零件材料要耐腐蚀。其次来看表冷器冷凝水排出口，此设备应具备自动防倒吸功能。此外，压差计用于机组内各级空气过滤器前后，并做好箱体密封。
7.制冷机房设计：这方面的设计必须根据前面这6项内容来确定，只有这样才能真正做好实验室洁净空调系统设计。
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